2021年，瀚微生物注册成立。创始人朱书教授现为中国科学技术大学教授、博士生导师、合肥综合性科学中心大健康研究院副院长，国家杰青。长期以来，朱书教授致力于研究肠道微生物的免疫识别、免疫调控、以及微生物创新疗法，在Cell 、Nature、Science发表多篇原创性论文。
朱书教授提到：“基于多年的科学理解和积累，我们意识到肠道微生物对人体疾病的潜在应用价值。虽然肠道菌群移植（FMT）已经在临床被证实对艰难梭菌、IBD、自闭症等多种疾病有效，但其作用机制尚不清晰。瀚微生物要做的，就是将科学发现切实转化成药物，让实验室科学创造临床价值，破解肠道菌群机制不清的黑匣子。“
基于朱书教授及团队17年的学术积累，以及瀚微生物成立以来搭建的“学术+工业”的人才团队，包括由耶鲁大学、哈佛大学、中科院、复旦、中科大等国际一流高校的微生物学、免疫学、神经生物学、分析化学、药物化学博士组成的核心研发团队，以及从GSK等多位知名企业出身的研发及管理人员，瀚微生物目前已建立起免疫及神经调节功能筛选、单菌代谢产物分析、天然产物合成生物学改造等一系列特色平台，以及菌种分离鉴定、发酵工艺放大、药物申报临床等完备的团队。
朱书教授表示，“在重大慢性疾病治疗，儿童、老年人、孕期、哺乳期等用药敏感人群用药等方面，活体微生物药物都有着独特优势。同时，作为递送载体、以其组分或代谢产物开发药物、影响改善其他药物用药等方面，活体微生物药物都具有更大的潜力和想象空间。瀚微生物正全力加速管线研发，希望尽早推出活体微生物药的第一个重磅应用。也欢迎同各方力量合作，发挥各自优势，共同开发推广，推动微生物及相关疗法造福亿万免疫及神经疾病患者。”
辰德资本投资团队表示，“肠道微生物不仅维持着肠道稳态，还和人体多个生理和病理过程相关。肠道微生物可以调控糖、脂肪等代谢，调节免疫系统影响PD-1等肿瘤免疫疗法的效果，还通过脑肠轴参与调控神经系统等。近期，第一个活菌药物在FDA获批上市，行业越来越受到大家的关注。瀚微生物在创始人朱书教授的带领下，建立了独有的活菌药物筛选平台，并建立了覆盖神经、代谢、免疫等方向的多个产品管线，部分产品正在临床验证阶段。我们看好活菌药物在治疗多种疾病上的巨大潜能，希望公司产品加快研发进度，早日来到患者身边。”
中金资本项目负责人赵新昊博士表示，从基础研究角度看，微生态药物完成由疾病相关性到因果性研究的转变，基础研究逐渐成熟且具有转化的价值；行业发展方向看，目前全球在不同疾病领域包括神经精神类疾病，代谢类疾病，自身免疫性疾病，菌群紊乱和肿瘤等领域均有快速的发展；从产品成药性方向看，去年和今年分别有微生态新药获FDA批准上市，药品的形态完成了初步的验证。站在微生物赛道的起点，我们看到瀚微的全球竞争力和赛道的成长性，对未来充满希望。瀚微生物在微生物赛道上独树一帜，在脑肠轴和自免与微生物关系方面完成了很多突破性发现，并且在病因学和微生物干预，代谢产物干预等方向做了深入的转化研究，临床上也完成了初步的验证，奠定了他们在这些方向的开发FIC药物的竞争力。我们希望通过本次投资，实现中金资本与团队的携手互补，助力企业在临床转化，团队构建方向实现新的飞跃，将微生物药物惠及更多患者。
